postaw sobie na serwerze apache+php, i za pomocą komendy shell_exec
możesz sobie wykonywać polecenia z linii komend.
Piszesz prostą stronkę, w której wpisujesz np w okienku texarea sobie komendy, przesyłasz je do serwera (submit) i nastepnie wykonujesz tą komendą, Zwróconego stringa zwracasz sobie na ekran.
Takie projekty już istnieją i są darmowe.
Bibliografia:
http://pl.php.net/manual/en/function.shell-exec.php <-funkcja shell_exec
http://www.psychogenic.com/en/products/PHPsh.php <-przykladowy projekt
Troche wiecej przykladow
Wymienilem tylko rozwiazania w php, a do wyboru masz jeszcze wlasnie caly mechanizm cgi, asp, jsp itd..
Acha, pamiętaj - google to potęga
EDIT: jakotakie okno dosowe to mozesz sobie zasymulowac powiedzmy w javie lub flashu, ktory bedzie odpowiednie komendy wysylal do serwera i wyswietlal wyniki ich dzialania.
Pamietaj tylko o zabezpieczeniu tej strony jakims haslem
